真核生物的
許多生化代謝過程,如糖酵解、三羧酸循環(huán)和β氧化,都會產(chǎn)生還原型輔酶NADH。此輔酶含有高電極電勢的電子;也就是說,它們將在氧化時釋放出大量的能量。然而,細胞不會一次性釋放完全部的能量,因為在這種情況下,反應(yīng)將無法控制。相反,電子從NADH釋放出來,并通過一系列的酶傳遞給氧氣,其中每步只釋放少量的能量。由復(fù)合體I到IV組成的這組酶稱為電子傳遞鏈,存在于線粒體內(nèi)膜中。琥珀酸也被電子傳遞鏈氧化,但起點不同。 真核生物中,電子傳遞系統(tǒng)中的酶用從氧化NADH釋放的能量,泵送質(zhì)子穿過線粒體內(nèi)膜。這會使質(zhì)子在膜間隙中積聚,產(chǎn)生跨膜電化學(xué)梯度。然后,ATP合酶使用存儲在其中的勢能以產(chǎn)生ATP。其中,真核細胞線粒體中的氧化磷酸化是這一過程研究最為透徹的樣例。線粒體存在于幾乎所有的真核生物中,但部分原生生物例外,如陰道毛滴蟲中稱為氫化酶體的殘留線粒體會將質(zhì)子還原為氫。 呼吸酶 | 氧化還原對 | 中點電位(伏) |
NADH脫氫酶 | NAD/NADH | ?0.32 |
琥珀酸脫氫酶 | | ?0.20 |
細胞色素bc復(fù)合體 | 輔酶Q10/ 輔酶Q10 | +0.06 |
細胞色素bc復(fù)合體 | 細胞色素b/ 細胞色素b | +0.12 |
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NADH-Q還原酶,又稱“NADH脫氫酶”或“復(fù)合體I”,是電子傳遞鏈中的第一個蛋白。它是一個巨大的酶,在哺乳動物中該復(fù)合體由46亞基組成,有1000千道爾頓(kDa)。目前只了解一種細菌的復(fù)合體詳細結(jié)構(gòu);大多數(shù)生物的復(fù)合體酷似有一個大“球”的靴子,從膜中穿到線粒體。編碼單個蛋白質(zhì)的基因同時包含在細胞核和線粒體基因組中,許多線粒體酶都是這種情況。 此酶催化的反應(yīng)為NADH被輔酶Q10,即線粒體膜上的一種脂溶性醌類“泛醌”(在下面公式中寫作Q)所氧化,同時轉(zhuǎn)移兩個電子: 這個反應(yīng)乃至于整個電子鏈,是從NADH分子與復(fù)合體I結(jié)合及放出兩個電子而開始。電子通過附著在其上的黃素單核苷酸(FMN)輔基進入復(fù)合體I。電子的加入使FMN轉(zhuǎn)換為它的還原形式,F(xiàn)MNH。電子隨后通過一系列存在于復(fù)合體中的第二種輔基鐵硫簇轉(zhuǎn)移。復(fù)合體I中存在兩種鐵硫簇,[2Fe-2S]和[4Fe-4S]。 電子穿過復(fù)合體時,有4個質(zhì)子從基質(zhì)泵入膜間隙。尚不清楚其中的機制,但似乎與復(fù)合體I的構(gòu)象改變有關(guān),這可使該蛋白質(zhì)在膜的N側(cè)結(jié)合質(zhì)子,并在P側(cè)釋放它們。最后,電子從鐵硫簇鏈轉(zhuǎn)移到膜中的泛醌分子上。泛醌的還原也有助于質(zhì)子梯度的產(chǎn)生,因為基質(zhì)中的兩個質(zhì)子被用于泛酚(QH)的還原。
琥珀酸-Q氧化還原酶,又稱“復(fù)合體II”或“琥珀酸脫氫酶”,是電子傳遞鏈的第二個入口。它很特別,因為它是唯一一個既屬于三羧酸循環(huán)、又屬于電子傳遞鏈的酶。復(fù)合體II包含四個蛋白質(zhì)亞基,一個附著的黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)輔因子,鐵硫簇,和一個不參與將電子轉(zhuǎn)移到輔酶Q、但被認為在降低氧化物活性上起重要作用的血紅素基團。它將琥珀酸氧化為延胡索酸,將泛醌還原。該反應(yīng)釋放的能量比氧化NADH少,因此復(fù)合體II不運輸質(zhì)子穿過膜,不會影響質(zhì)子梯度。 一些真核生物,如寄生蟲豬蛔蟲,有類似復(fù)合體II的延胡索酸還原酶(甲基萘醌:延胡索酸氧化還原酶,又稱QFR),但功能相反,其氧化泛醌而還原延胡索酸。這使蠕蟲可以在大腸的厭氧環(huán)境中生活,將延胡索酸作為電子受體進行厭氧氧化磷酸化。復(fù)合體II的另一種非常規(guī)功能在引起瘧疾的寄生蟲“惡性瘧原蟲”中得到體現(xiàn)。在這里作為氧化酶,復(fù)合體II的逆作用對泛酚的再生很重要,寄生蟲將其用于一個不尋常的生物合成嘧啶的方式。 電子傳遞黃素蛋白-Q氧化還原酶
電子傳遞黃素蛋白-泛醌氧化還原酶(ETF-Q氧化還原酶),又稱“電子傳遞-黃素蛋白脫氫酶”,是電子傳遞鏈的第三個入口。它是接收線粒體基質(zhì)中電子傳遞黃素蛋白的電子,并用這些電子還原泛醌的酶。這種酶包含一個黃素和一個[4Fe-4S]簇,但不像其它的呼吸鏈復(fù)合體,它只附著在膜的表面,不跨越脂質(zhì)雙分子層。 哺乳動物中,該代謝途徑在脂肪酸的β氧化和氨基酸及膽堿的分解代謝作用中很重要,因為它接受來自多個乙酰輔酶A脫氫酶的電子。在植物中,ETF-Q氧化還原酶也對使植物可以在長時間的黑暗中生存下來的代謝反應(yīng)重要。 Q-細胞色素c氧化還原酶(復(fù)合體III)
Q-細胞色素c氧化還原酶又稱“細胞色素c還原酶”、“細胞色素bc復(fù)合體”,或簡稱“復(fù)合體III”。在哺乳動物中,這種酶是一個二聚體,每個亞基包含11個蛋白質(zhì)亞基,1個[2Fe-2S]鐵硫簇和3個細胞色素:1個細胞色素c和2個細胞色素b。細胞色素是一種傳輸電子的蛋白,包含至少一個血紅素基團。當(dāng)電子通過蛋白傳遞時,復(fù)合體III中血紅素基團內(nèi)的鐵原子在還原型二價鐵(+2)和氧化型三價鐵(+3)之間切換。 復(fù)合體III催化的反應(yīng)是一分子泛酚的氧化和兩分子細胞色素c的還原,血紅素蛋白部分與線粒體相關(guān)。不同于輔酶Q攜帶兩個電子,細胞色素c只攜帶一個電子。 作為反應(yīng)中唯一可將電子從QH供體轉(zhuǎn)移到細胞色素c受體的物質(zhì),復(fù)合體Ⅲ的反應(yīng)機理較其他呼吸復(fù)合物認識更為詳盡,其包含兩個步驟,稱作Q循環(huán)。首先在第一步中,酶與三個QH底物結(jié)合,然后將其氧化,并將所產(chǎn)生的一個電子傳遞到第二個底物細胞色素C。QH所釋放的兩個質(zhì)子被傳遞到膜間隙。第三個底物Q接受來自QH的第二個電子,而還原為泛半醌自由基Q。先前的兩個底物被釋放,但這個泛半醌中間體仍然被酶所結(jié)合。第二步中,第二個QH分子與酶結(jié)合,再一次將它的第一個電子傳遞給細胞色素c受體。結(jié)合的泛半醌得到第二個電子,并獲得線粒體基質(zhì)中的兩個質(zhì)子,而還原為QH。這個QH隨后被酶釋放。 當(dāng)輔酶Q在膜的內(nèi)側(cè)還原為泛酚,而在另一面氧化為泛醌時,質(zhì)子的跨膜凈轉(zhuǎn)移隨之發(fā)生,從而增加了質(zhì)子梯度。通過相當(dāng)復(fù)雜的兩步機制完成反應(yīng)是重要的,因為它增加了質(zhì)子轉(zhuǎn)移的效率。如果替換Q循環(huán),直接用一個QH分子來還原兩個細胞色素c分子,則每還原一個細胞色素c只能傳送一個質(zhì)子,效率將會減半。
細胞色素c氧化酶(復(fù)合體IV)
細胞色素c氧化酶,又稱“復(fù)合體IV”,是在電子傳遞鏈的最后一個蛋白質(zhì)復(fù)合體。哺乳動物的酶有極其復(fù)雜的結(jié)構(gòu),包含13個亞基,2個血紅素基團,以及多種金屬離子輔因子——總計3個銅原子,1個鎂原子和1個鋅原子。
這種酶承載了電子傳遞鏈的最終反應(yīng),在跨膜泵送質(zhì)子時將電子轉(zhuǎn)移到氧上。這一步,氧作為最終電子受體,也稱“末端電子受體”,被還原為水。直接泵送的質(zhì)子和在氧的還原中消耗的基質(zhì)中質(zhì)子都能影響質(zhì)子梯度。所催化的反應(yīng)為細胞色素c的氧化及氧的還原:
替代的還原酶和氧化酶
許多真核生物的電子傳遞鏈中的酶與上述研究較多的哺乳動物有所不同。例如,植物有替代的NADH氧化酶,可以不在線粒體基質(zhì)而在細胞質(zhì)中氧化NADH,并將這些電子傳遞到泛醌池。這些酶不傳送子,可在不改變跨膜電化學(xué)梯度時還原泛醌。
分岔電子傳遞鏈的另一個例子是“替代氧化酶”,存在于植物、一些真菌及原生生物中,一些動物也可能包含其中。這種酶可直接將泛酚中的電子轉(zhuǎn)移到氧。
通過這些替代NADH和泛醌氧化酶的電子傳遞途徑比完整路徑的ATP產(chǎn)量低。這些捷徑的優(yōu)點尚不明確。然而,替代氧化酶產(chǎn)生于應(yīng)激反應(yīng),如受寒、活性氧、病原體感染,及其他抑制完整電子傳遞鏈的因素。因此,替代途徑可能可以通過減少氧化應(yīng)激,從而提高生物對傷害的抵抗力。
復(fù)合體組織
最初的呼吸鏈復(fù)合體組織模型認為它們互相獨立,在線粒體膜中自由擴散。然而,最近的數(shù)據(jù)表明,復(fù)合體可能形成稱為超復(fù)合體或“呼吸體”的高級結(jié)構(gòu)。在此模型中,各個復(fù)合體存在于有相互作用酶的有序集合中。這些關(guān)聯(lián)可能使各種酶復(fù)合體之間建立了底物通道,增加電子轉(zhuǎn)移的速率和效率。在哺乳動物的這些超復(fù)合體中,某些部件的數(shù)量可能較其它的要多,部分數(shù)據(jù)表明復(fù)合體I/II/III/IV和ATP合酶的比大致為1:1:3:7:4。然而,對超復(fù)合體假說的爭論仍未完全結(jié)束,因為部分數(shù)據(jù)似乎無法支持此模型。