黃原（陜西師范大學(xué)教授、博士生導(dǎo)師）

人物介紹

主要研究領(lǐng)域及興趣

黃原教授的《分子進(jìn)化生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室》主要從事分子進(jìn)化和分子系統(tǒng)學(xué)研究，包括利用高通量測(cè)序技術(shù)獲得的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)研究直翅目昆蟲和鳥類主要類群的時(shí)空演化模式和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，利用DNA復(fù)合條形碼技術(shù)進(jìn)行土壤和水體生物多樣性編目和群落演化研究。近期的研究項(xiàng)目包括：直翅目昆蟲的轉(zhuǎn)錄組學(xué)和譜系基因組學(xué)研究；鳥類和直翅目昆蟲的線粒體基因組學(xué)研究；基于DNA復(fù)合條形碼技術(shù)研究秦巴山區(qū)土壤和水體生物群落的多樣性及演化動(dòng)態(tài)。

承擔(dān)的科研項(xiàng)目

1. 主持國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的直翅目昆蟲譜系基因組學(xué)研究，2014.1.1-2017.12.31，項(xiàng)目批號(hào)31372192。

2. 主持國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，直翅目昆蟲的比較及進(jìn)化線粒體轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究， 2012.1.1-2015.12.31，項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)31172076。

3. 主持國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，直翅目昆蟲線粒體基因組的進(jìn)化型式和速率以及與飛行能力和生態(tài)型關(guān)系的研究，2010.1.1-2012.12.31，項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)30970346。

4. 主持國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，多新翅類昆蟲的線粒體譜系基因組學(xué)研究，2007.1.1-2009.12.31，項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)30670279。

5. 主持國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，直翅目昆蟲的比較及進(jìn)化線粒體基因組學(xué)， 2005.1.1-2007.12.31，項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)30470238。

6. 主持國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，昆蟲葡萄糖6磷酸脫氫酶基因結(jié)構(gòu)和序列進(jìn)化的比較研究，2001.1.1-2003.12.31，項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)3007011416。

7. 主持國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目，直翅目昆蟲mtDNA的分子系統(tǒng)學(xué)研究，19951.1.1-1998.12.31，項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)39570110。

8. 主持教育部?jī)?yōu)秀青年教師基金，單拷貝核基因的分子系統(tǒng)學(xué)研究，1999.1.1-2002.12.31。

9. 主持中國博士后科學(xué)基金，蚜蟲的分子系統(tǒng)學(xué)研究，1992-1994。

出版的著作

黃原，2012，分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué)，科學(xué)出版社。

黃原，盧慧甍，鄭哲民，2004，中國蝗總科分類鑒定專家系統(tǒng)（ESCA），中國農(nóng)業(yè)出版社。

黃原，1998，分子系統(tǒng)學(xué)：原理、方法及應(yīng)用，中國農(nóng)業(yè)出版社。

代表性論文

Hojun Song, Christiane Amedegnato, Maria Marta Ciglianod, Laure Desutter-Grandcolasc, Sam W. Heads, Yuan Huang(黃原), Daniel Otte and Michael F. Whiting. 300 million years of diversification: elucidating the patterns of orthopteran evolution based on comprehensive taxon and gene sampling. Cladistics (2015) 1–31.

Xiaoyang Wang, Nian Liu, Hongli Zhang, Xiao-Jun Yang, Yuan Huang*(黃原), Fumin Lei. Extreme variation in patterns of tandem repeats in mitochondrial control region of yellow-browed tits (Sylviparus modestus, Paridae). Scientific Reports 5, Article number: 13227 (2015). doi:10.1038/srep13227.

Li Xuejuan, Huang Yuan*(黃原), Lei Fumin. Comparative mitochondrial genomics and phylogenetic relationships of the Crossoptilon species (Phasianidae, Galliformes). BMC Genomics. 2015 Feb 5; 16: 42. doi: 10.1186/s12864-015-1234-9.

Huang Jianhua, Zhang Aibin, Mao Shaoli, Huang Yuan*(黃原). DNA Barcoding and Species Boundary Delimitation of Selected Species of Chinese Acridoidea (Orthoptera: Caelifera). PLoS ONE, 2013, 8(12): e82400.

Hongli Zhang, Ling Zhao, Zhemin Zheng, Huang Yuan(黃原). Complete Mitochondrial Genome of Gomphocerus sibiricus (Orthoptera: Acrididae) and Comparative Analysis in Four Gomphocerinae Mitogenomes. Zoological science, 2013, 30 (3): 192-204.

Hongli Zhang, Huihua Zeng, Yuan Huang(黃原), Zhemin Zheng, The complete mitochondrial genomes of three grasshoppers, Asiotmethis zacharjini, Filchnerella helanshanensis and Pseudotmethis rubimarginis (Orthoptera: Pamphagidae). Gene, 2013, 517: 89–98.

Haiyan Ye, Li-Li Xiao, Zhijun Zhou, Yuan Huang*(黃原). Complete Mitochondrial Genome of Locusta migratoria migratoria (Orthoptera: Oedipodidae): Three tRNA-like Sequences on the N-strand". Zoological Science, 2012, 29(2):90-96.

Ling Zhao, Zhemin Zheng, Yuan Huang*(黃原), Zhijun Zhou, Li Wang. Comparative analysis of the mitochondrial control region in Orthoptera. Zool Study, 2011, 50(3): 385-393.

Nian Liu, Yuan Huang*(黃原). Complete mitochondrial genome sequence of Acrida cinerea (Acrididae: Orthoptera) and comparative analysis of mitochondrial genomes in Orthoptera. Comparative and functional genomics，2010, Article ID 319486. doi:10.1155/2010/319486.

Zhijun Zhou, Fuming Shi, Yuan Huang*(黃原). The complete mitogenome of the Chinese bush cricket, Gampsocleis gratiosa (Orthoptera: Tettigonioidea). Journal of Genetics and Genomics, 2010, 35 (6), 341-348.

Huimin Sun, Zhemin Zheng, Yuan Huang*(黃原). Sequence and phylogenetic analysis of complete mitochondrial DNA genomes of two grasshopper species Gomphocerus rufus and Primnoa arctica (Orthoptera: Acridoidea). Mitochondrial DNA, 2010, 21 (3-4), 115-131.

Ling Zhao, Z Zheng, Y Huang*(黃原), H Sun. A comparative analysis of mitochondrial genomes in Orthoptera (Arthropoda: lnsecta) and genome descriptions of three grasshopper species. Zoological science, 2010, 27 (8): 662-672.

Zhijun Zhou, Yuan Huang*(黃原), Fuming Shi, Haiyan Ye. The complete mitochondrial genome of Deracantha onos (Orthoptera: Bradyporidae). Molecular biology reports, 2009, 36 (1), 7-12.

Chenyan Zhang, Yuan Huang*(黃原). Complete mitochondrial genome of Oxya chinensis (Orthoptera, Acridoidea). Acta Biochimica et Biophysica Sinica, 2008, 40 (1), 7-18.

Zhijun Zhou, Yuan Huang*(黃原), Fuming Shi. The mitochondrial genome of Ruspolia dubia (Orthoptera: Conocephalidae) contains a short A+ T-rich region of 70 bp in length. Genome, 2007, 50 (9): 855-866.

Huimeng Lu, Yuan Huang*(黃原). Phylogenetic relationship of 16 Oedipodidae species (Insecta: Orthoptera) based on the 16S rRNA gene sequences. Insect Science, 2006, 13 (2), 103-108.

Yuan Huang（黃原）, G Ort??, M Sutherlin, A Duhachek, A Zera. Phylogenetic relationships of North American field crickets inferred from mitochondrial DNA data. Molecular phylogenetics and evolution, 2000, 17 (1): 48-57.

Anthony J Zera, Yuan Huang(黃原). Evolutionary endocrinology of juvenile hormone esterase: functional relationship with wing polymorphism in the cricket, Cryllus firmus. Evolution, 1999, 53(3): 837-847.

獲獎(jiǎng)情況

《中國蝗蟲的分子系統(tǒng)學(xué)和分類鑒定》，2010年獲得陜西省科學(xué)技術(shù)二等獎(jiǎng)，第一完成人。