NgAgo-gDNA是由河北科技大學(xué)副教授韓春雨及其研究小組研發(fā)出的一種新的基因編輯技術(shù)。有專家評(píng)論,盡管這種技術(shù)尚處于初期階段,但其潛力有望超過(guò)近來(lái)被看作諾貝爾獎(jiǎng)熱門(mén)的CRISPR-Cas9技術(shù)。

近日,河北科技大學(xué)基因編輯技術(shù)研究中心與丹麥諾維信公司(Novozymes A/S)就NgAgo技術(shù)的應(yīng)用與開(kāi)發(fā)達(dá)成合作,并簽署協(xié)議。 8月3日凌晨,《自然·生物技術(shù)》雜志在其網(wǎng)站上刊登出此前飽受爭(zhēng)議的韓春雨團(tuán)隊(duì)的撤稿聲明。圍繞在韓春雨身上持續(xù)一年多有關(guān)NgAgo-gDNA基因編輯問(wèn)題的爭(zhēng)議,終于,以他的主動(dòng)撤稿而告一段落了。

外文名

NgAgo-gDNA

屬性

基因編輯技術(shù)

核酸酶

NgAgo

發(fā)明者

韓春雨

原理

在引導(dǎo)工具的引導(dǎo)下,令核酸酶對(duì)特定位點(diǎn)的基因序列進(jìn)行切割,從而進(jìn)行基因編輯

技術(shù)原理

NgAgo-gDNA技術(shù)是以DNA作為引導(dǎo)工具的基因編輯技術(shù)。NgAgo-gDNA技術(shù)的工作原理與CRISPR-Cas9技術(shù)有些類似,都是在引導(dǎo)工具的引導(dǎo)下,令核酸酶對(duì)特定位點(diǎn)的基因序列進(jìn)行切割,從而進(jìn)行基因編輯。不同的是NgAgo-gDNA技術(shù)中所用到的引導(dǎo)工具是一段引導(dǎo)DNA(gDNA)而不是CRISPR-Cas9技術(shù)中的RNA。由于也不需要通過(guò)蛋白(如鋅指蛋白)來(lái)尋找需要替換的序列,因此,NgAgo-gDNA技術(shù)與CRISPR-Cas9技術(shù)一樣,較之前的基因編輯技術(shù),在操作上要簡(jiǎn)單方便得多,利于其在應(yīng)用中的推廣。

NgAgo-gDNA技術(shù)所用的核酸酶是NgAgo,一種存在于格氏嗜鹽堿桿菌(Natronobacteriumgregoryi)中的Ago內(nèi)切核酸酶蛋白。Ago核酸酶最初是由荷蘭科學(xué)家發(fā)現(xiàn)其可以有效地利用單鏈DNA作為短介質(zhì),去相對(duì)精準(zhǔn)地切割基因組靶點(diǎn)。而最初的研究的局限性在于實(shí)驗(yàn)所需要的溫度在65-75攝氏度,不能在生理?xiàng)l件下完成。而通過(guò)韓春雨教授團(tuán)隊(duì)的不斷搜尋,最終他們發(fā)現(xiàn)來(lái)自于格氏嗜鹽堿桿菌的Ago同源蛋白可以在生理?xiàng)l件下實(shí)現(xiàn)類似的功能。

NgAgo-gDNA技術(shù)可能比CRISPR-Cas9技術(shù)擁有更多優(yōu)勢(shì),與CRISPR-Cas9技術(shù)相比,NgAgo-gDNA技術(shù)可編輯的靶位點(diǎn)的選擇范圍更大。因?yàn)镃as9需要與基因組上19個(gè)堿基配對(duì),并要求在這組堿基后緊鄰一個(gè)特定的三堿基序列(PAM序列),一定程度上限制了靶位點(diǎn)的選擇范圍,而NgAgo-gDNA技術(shù)中靶位點(diǎn)的選擇則不受PAM序列的限制,編輯對(duì)象所受限制更小,幾乎能編輯基因組內(nèi)任何位置。

另外,與NgAgo結(jié)合的gDNA長(zhǎng)度為24個(gè)堿基,這比與Cas9結(jié)合的19個(gè)堿基的gRNA要長(zhǎng)5個(gè)堿基,理論上其精確性要提高1024(4的5次方)倍。并且韓春雨團(tuán)隊(duì)的研究還發(fā)現(xiàn),與CRISPR-Cas9相比,NgAgo–gDNA系統(tǒng)對(duì)向?qū)蛄?靶序列錯(cuò)配容忍度很低。編輯精準(zhǔn)度更高,能更有效地避免脫靶現(xiàn)象。[1]

媒體評(píng)論

《自然》雜志執(zhí)行主編尼克坎貝爾評(píng)論說(shuō):“雖然這項(xiàng)新技術(shù)還處于初期,但有一些理由讓我們相信它與現(xiàn)在普遍使用的CRISPR-Cas9技術(shù)相比有多種優(yōu)勢(shì),特別是在更精準(zhǔn)的基因編輯方面?!蔽覀冋J(rèn)為NgAgo-gDNA基因編輯技術(shù)與之前的基因編輯技術(shù)相比各有特點(diǎn),可能存在一定的優(yōu)勢(shì),但其推廣應(yīng)用還需更進(jìn)一步的研究來(lái)驗(yàn)證。由于基因編輯技術(shù)整體在科學(xué)上和商業(yè)上擁有較好的發(fā)展前景,并且NgAgo-gDNA技術(shù)是中國(guó)科學(xué)家首次發(fā)明,擁有知識(shí)產(chǎn)權(quán)優(yōu)勢(shì),建議關(guān)注該技術(shù)的研究進(jìn)展。[1]

論文爭(zhēng)議

《自然-生物技術(shù)》發(fā)布聲明指出,該期刊已獲得有關(guān)韓春雨實(shí)驗(yàn)可重復(fù)性的新數(shù)據(jù),需要調(diào)查研究這些數(shù)據(jù)。聲明稱,關(guān)于“利用NgAgo進(jìn)行DNA引導(dǎo)的基因組編輯”論文,《自然-生物技術(shù)》仍然致力于盡可能仔細(xì)和負(fù)責(zé)任地探究圍繞韓春雨等人論文的擔(dān)憂。

聲明指出,自2016年11月28日發(fā)布Cathomen等人的通信文章和編輯部關(guān)注以來(lái),期刊獲得了與NgAgo系統(tǒng)可重復(fù)性相關(guān)的新數(shù)據(jù),在決定是否采取進(jìn)一步行動(dòng)之前,我們需要調(diào)查研究這些數(shù)據(jù)。

中國(guó)河北科技大學(xué)的韓春雨及其團(tuán)隊(duì)于2016年5月在全球著名學(xué)術(shù)刊物《自然》的子刊《自然-生物技術(shù)》上報(bào)告發(fā)明了一種新的基因編輯技術(shù)NgAgo-gDNA。論文稱,與當(dāng)前基因編輯領(lǐng)域內(nèi)的主流技術(shù)CRISPR-Cas9相比,NgAgo-gDNA在一些方面具有優(yōu)勢(shì)。但隨后,中國(guó)以及國(guó)外都有學(xué)者公開(kāi)表示無(wú)法重復(fù)論文中描述的實(shí)驗(yàn),這項(xiàng)研究成果遭到多方質(zhì)疑。

2016年11月,《自然-生物技術(shù)》就韓春雨論文爭(zhēng)議發(fā)表了“編輯部關(guān)注”,同時(shí)發(fā)表了一篇國(guó)際研究人員關(guān)于不能重復(fù)相關(guān)技術(shù)的文章,表示將在2017年1月完成相關(guān)調(diào)查。

《自然·生物技術(shù)》雜志充分肯定了其研究的意義所在?!斑@篇有關(guān)NgAgo的論文發(fā)表出來(lái),并不是科研過(guò)程的結(jié)束,而是開(kāi)始。