測(cè)序深度,測(cè)序得到的堿基總量(bp)與基因組大?。℅enome)的比值,它是評(píng)價(jià)測(cè)序量的指標(biāo)之一。

基本內(nèi)容

概念介紹

測(cè)序深度(Sequencing Depth):測(cè)序得到的堿基總量(bp)與基因組大?。℅enome)的比值,它是評(píng)價(jià)測(cè)序量的指標(biāo)之一。測(cè)序深度與基因組覆蓋度之間是一個(gè)正相關(guān)的關(guān)系,測(cè)序帶來(lái)的錯(cuò)誤率或假陽(yáng)性結(jié)果會(huì)隨著測(cè)序深度的提升而下降。重測(cè)序的個(gè)體,如果采用的是雙末端或Mate-Pair方案,當(dāng)測(cè)序深度在10~15X以上時(shí),基因組覆蓋度和測(cè)序錯(cuò)誤率控制均得以保證。