光合作用 綠色細(xì)胞中發(fā)生的生化反應(yīng)
光合作 用 (英文:photosynthesis)是地球上最重要的生物進(jìn)程之一,發(fā)生于植物的 葉綠體 中。其過程為細(xì)胞利用光能將二氧化碳(CO 2 )和水(H 2 O)轉(zhuǎn)化為 碳水化合物 并釋放氧氣,反應(yīng)方程如下 : 光合作用通常需要兩個(gè)步驟:光反應(yīng)和暗反應(yīng),而光反應(yīng)又可大致分為原初反應(yīng)、同化力形成(包括電子傳遞和光合磷酸化反應(yīng))兩個(gè)步驟,暗反應(yīng)可認(rèn)為是碳同化發(fā)生的過程。 通常發(fā)生在植物(包括C3途徑、C4途徑、CAM途徑)、 藻類 (植物型光合作用)和 細(xì)菌 (細(xì)菌型光合作用)中。 光合作用對于整個(gè) 生物界 都有重要意義,是生物界最基本的物質(zhì)代謝和能量代謝,也是地球 碳氧循環(huán) 的重要媒介。
名稱由來 地球上的生命都最終取決于來自太陽的能量,而光合作用又是唯一能收獲這種能量的具有意義的過程。Photosynthesis(光合作用)一詞字面意思便是利用光去合成(synthesis using light)。
演化過程 起初地球上是沒有生物的,地表僅存在由紫外線光解水產(chǎn)生的微量自由態(tài)氧氣。經(jīng)過幾億年的變化形成了較為復(fù)雜的 有機(jī)物 后,從這些 有機(jī)物 和無機(jī)物的相互作用過程中衍生出了最初的生物,依靠現(xiàn)有的 有機(jī)物 質(zhì)繁殖。 在這之后,從這些原始生物中發(fā)展出了一些帶有 光合色素 、可利用太陽光合成 有機(jī)物 的微生物,能進(jìn)行不釋放氧氣的光合作用,伴隨著硫化氫等物質(zhì)的氧化消耗。 經(jīng)過很長時(shí)間的演化,從這類微生物中衍生出了單細(xì)胞 藻類 那樣的低等植物,可以進(jìn)行釋放氧氣的光合作用。它們在水中進(jìn)行光合作用,因此地表含量巨大的水無窮無盡地為生物提供著氧化底物,保證了地球上 有機(jī)物 質(zhì)和氧氣的大量積累,從而發(fā)展出了如今各種各樣的生物。 光合作用的基因可能同源。羅伯特 ·布來肯細(xì)普團(tuán)隊(duì)利用 BLAST 檢驗(yàn)了五種細(xì)菌的基因,發(fā)現(xiàn)其中有50個(gè)光合作用相關(guān)基因相似,因此他們對其進(jìn)行親緣關(guān)系分析,最終發(fā)現(xiàn)這些基因有著不同的演化史,只有少數(shù)同源基因,大多數(shù)的共同基因參與日常代謝反應(yīng),然后才被收納稱為光合系統(tǒng)的一部分。
發(fā)生場所 光合作用發(fā)生在植物的 葉綠體 中,而 葉綠體 主要存在于葉肉細(xì)胞中,因此說陸生植物的葉子的基本功能就是發(fā)生光合作用。 除植物外,部分 光合細(xì)菌 也可以進(jìn)行光合作用。 光合細(xì)菌 (photosynthetic bacteria)是一類含有 光合色素 的 原核生物 ,可以在厭氧光照條件下利用光能以二氧化碳或含碳 有機(jī)物 作為碳源進(jìn)行不產(chǎn)生氧氣的光合作用。
基本原理 光合作用包括光反應(yīng)(光驅(qū)動反應(yīng),發(fā)生在 類囊體 膜上)和暗反應(yīng)(碳反應(yīng),發(fā)生在 葉綠體 基質(zhì))。 光合作用的光反應(yīng)與暗反應(yīng)(Taiz, Zeiger, 2010)
光反應(yīng) 光反應(yīng)發(fā)生在 類囊體 膜上(thylakoid membrane),其上鑲嵌兩個(gè)串聯(lián)的光系統(tǒng)(PSI和PSII),捕捉光能,使水反應(yīng)生成氧氣,釋放到空氣中。 我們通常認(rèn)為光反應(yīng)由兩個(gè)部分組成:原初反應(yīng)階段(吸收并傳遞光能,轉(zhuǎn)化為電能)和同化力形成階段(電子傳遞及其耦聯(lián)的光合磷酸化完成)。
原初反應(yīng)階段 在此過程中,反應(yīng)中心的 葉綠素 a分子作為原初電子供體受光子激發(fā)發(fā)生 電荷分離 (charge separation),失去電子被氧化,電子傳遞給原初電子受體,受體接收電子被還原,開始電子傳遞系列反應(yīng)。光子的捕捉、傳遞過程由 光合色素 進(jìn)行。 同時(shí),光系統(tǒng)II(PSII)反應(yīng)中心的 葉綠素 a分子在被氧化后,會奪取附近水分子的電子后被還原,再進(jìn)行下一輪光化學(xué)反應(yīng)。
同化力形成階段 原初反應(yīng)后,發(fā)生光合電子傳遞,即PSII反應(yīng)中心的 葉綠素 a分子所失去的電子經(jīng)過一系列步驟,最終到達(dá)NADP ,將其還原為NADPH。 同時(shí),在與電子傳遞過程相耦聯(lián)的光合磷酸化反應(yīng)過程中,ADP和Pi在ATP合酶的催化下合成ATP。
在這兩個(gè)過程中,形成的NADPH和ATP統(tǒng)稱為同化力,用于下一階段的反應(yīng)進(jìn)行。
葉綠體中進(jìn)行光合作用的過程模式圖(許大全,2022)
暗反應(yīng) 暗反應(yīng)在葉綠體基質(zhì)中發(fā)生,又稱為卡爾文循環(huán)。 在此過程中,ATP和NADPH在酶的催化下氧化成NADP 和ADP+Pi,二氧化碳和水反應(yīng)生成碳水化合物,也是我們所說的糖類物質(zhì)。
光合碳循環(huán)分為以下三個(gè)階段:
羧化階段: 6 RuBP + 6 CO 2 12 3-PGA(在RuBisCO催化下進(jìn)行) RuBisCO是本階段重要的 酶 ,因?yàn)楣怙柡偷墓夂纤俾逝cRuBisCO的活性之間存在正相關(guān)性,它也常被稱為光合作用的限速酶。 在CO 2 濃度較低時(shí),光合速率隨著CO 2 濃度的升高而直線升高,而這條直線的斜率也被稱為羧化效率,同時(shí)羧化效率的大小可以判斷RuBisCO量的多少。
在CO 2 濃度較高時(shí),光合速率不再隨著CO 2 的濃度升高而升高,此時(shí)的光合速率通常被稱為葉片的光合能力,其大小依賴于RuBP再生能力的大小。
在CO 2 濃度適中的過渡階段,是從RuBP羧化限制到RuBP再生限制的轉(zhuǎn)變階段。
還原階段 12 3-PGA + 12 ATP + 12 NADPH 12 G3P + 12 ADP + 12 Pi + 12 NADP 還原階段同時(shí)進(jìn)行了磷酸化和NADPH 2 的還原。PGA是一種有機(jī)酸,若想轉(zhuǎn)化為三碳糖(如磷酸甘油醛),需要使用NADPH2和ATP的同化力中的能量。當(dāng)CO2被還原成三碳糖的水平時(shí),光合作用的貯能部分便結(jié)束了。
再生階段 10 G3P + 6 ATP 6 RuBP + 6 ADP + 4 Pi 再生階段是指通過一系列復(fù)雜的反應(yīng)將RuBP再生出來,使CO 2 固定反應(yīng)得以繼續(xù)。再生的過程受到同化力供應(yīng)的制約,因此需要光照。RuBP再生限制在某種程度上來說是可以反映光反應(yīng)的情況,并了解光化學(xué)效率的。
注釋 RuBP(ribulose bisphosphate)是一種在光合作用中依賴光的反應(yīng)第一階段形成的兩個(gè)三碳中間體,是一種五碳糖。
RuBisCO(核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶)是光合作用中催化二氧化碳進(jìn)行固定碳的關(guān)鍵 酶 ,屬于蛋白質(zhì)。 NADPH是一種輔因子(cofactor),用于為一些需要 酶 催化的反應(yīng)提供電子和氫。通常參與大分子合成的反應(yīng)使用NADPH,參與分子分解的反應(yīng)使用NADH。
不同生物的光合作用
C3途徑植物 C3途徑植物是一種具有特定碳同化途徑的植物:二氧化碳最初固定產(chǎn)物是一種含有三個(gè)碳原子的 有機(jī)物 。 C3途徑就是我們熟悉的卡爾文循環(huán),是美國加州大學(xué)的卡爾文(M. Calvin)及其同事于1946年通過 C同位素標(biāo)記法和雙向紙層析技術(shù)得出并闡明的。C3途徑發(fā)生在葉綠體基質(zhì)中。
C4途徑植物 二氧化碳最初固定產(chǎn)物是一種含有四個(gè)碳原子 有機(jī)物 的植物稱為C4途徑植物。 C4途徑又被稱為Hatch and Slack Cycle,也被稱為β-羧化途徑和協(xié)同光合作用,是由澳大利亞植物生理學(xué)家、生化學(xué)家Marshall Davidson Hatch和英國 植物生物學(xué)家、生化學(xué)家Charles Roger Slack研究甘蔗植物時(shí)得出的。在 酶 的催化下,二氧化碳和PEP(磷酸烯醇式丙酮酸)反應(yīng)形成OAA(草酰乙酸),OAA在蘋果酸脫氫酶的作用下轉(zhuǎn)化為蘋果酸。整個(gè)過程中,光反應(yīng)發(fā)生在葉肉細(xì)胞中,而CO 2 同化作用發(fā)生在葉肉的維管束鞘細(xì)胞中。
CAM途徑植物 CAM途徑又稱景天酸代謝途徑,是一種最先在景天科植物中發(fā)現(xiàn)的CO 2 特殊固定方式,如今已在二十多科植物中發(fā)現(xiàn)該途徑,如大戟科、百合科、仙人掌 科、蘭科、番杏科等,在裸子植物和蕨類植物中也有發(fā)現(xiàn)。常見的CAM途徑植物有仙人掌、蘆薈、龍舌蘭、鳳梨等。
特征 CAM植物在夜間開放葉片氣孔來吸收二氧化碳,在夜間積累合成的蘋果酸;而在白天,植物葉片氣孔關(guān)閉防止水分散失,并將蘋果酸轉(zhuǎn)化為淀粉或其他化合物。
分類 CAM途徑植物分為專一CAM和兼性CAM。專一CAM即使環(huán)境改變也會進(jìn)行夜晚固定二氧化碳、積累有機(jī)酸來保證光合作用;而兼性CAM是在水分充足或幼苗時(shí)期表現(xiàn)為C3途徑,在干旱炎熱、水分匱乏或完全發(fā)育成熟時(shí)表現(xiàn)為CAM途徑。 蘭科、番杏科、藤黃科、景天科、馬齒莧科、葡萄科等中都存在兼性CAM植物,該途徑幫助 植物降低水分消耗,在不適宜的環(huán)境條件下保持了光合作用的完整性,得以生存繁殖。
藻類與細(xì)菌 在細(xì)菌和藍(lán)綠藻類中,細(xì)胞質(zhì)中的載色體上存在光合作用反應(yīng)中心,組成了光合系統(tǒng),其包含了細(xì)菌葉綠素分子以外,還包含了色素、細(xì)胞色素、含有非血紅素鐵和銅的分子、脂質(zhì)、蛋白質(zhì)等。 這些生物體內(nèi)有固氮酶或氫化酶對反應(yīng)過程進(jìn)行催化,從而合成氫氣。
植物型光合作用 藍(lán)藻進(jìn)行植物型光合作用,采用環(huán)式電子傳遞的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)來提高卡爾文循環(huán)的效率,并能夠幫助光和生物快速適應(yīng) 環(huán)境變化。 經(jīng)固氮酶催化產(chǎn)氫反應(yīng)式為: 2 H + Fd + 4 ATP = H 2 + 4 ADP
細(xì)菌型光合作用 光合細(xì)菌暴露在光下時(shí)會誘導(dǎo)固氮酶激活,乳酸等 有機(jī)物 充當(dāng)電子供體時(shí),可以產(chǎn)生氫氣。目前Rhodobacter sphaeroides已被認(rèn)為是產(chǎn)氫率最高的細(xì)菌(可達(dá)260ml/mg/h),其光能轉(zhuǎn)化效率為7%(意味著它產(chǎn)生的氫氣燃燒所產(chǎn)生能量為吸收太陽能的7%),進(jìn)一步開發(fā)可與太陽能電池的轉(zhuǎn)化效率相當(dāng)。 經(jīng)固氮酶催化產(chǎn)氫反應(yīng)式為:
C 3 H 6 O 3 + 3 H 2 O = 12 H + 3 CO 2 + 12 e = 6 H 2 + 3 CO 2
研究歷史 在多國科學(xué)家的努力下,建立光合作用的化學(xué)方程式歷時(shí)上百年。
參與反應(yīng)氣體的發(fā)現(xiàn) 最初在1771年,普里斯特利(Joseph Priestley)在研究氣體時(shí)分離了八種氣體,并描述了他們的特征。當(dāng)時(shí)人們受到亞里士多德的教導(dǎo),相信只有一種空氣,而普里斯特利的實(shí)驗(yàn)證實(shí)說明了不同物質(zhì)中釋放不同空氣。后針對實(shí)驗(yàn)結(jié)果展開可燃性原理的假說并付諸實(shí)驗(yàn),將氧氣稱為了“去燃素空氣(dephlogisticated air)” 1777年,拉瓦錫(Antonie-Laurent Lavoiser)向科學(xué)院提交了《燃燒概論》的文章,將中一種氣體稱為“氧氣(oxygen)”,解釋了燃燒的本質(zhì)。
光合作用的發(fā)現(xiàn)進(jìn)程 1779年,出生于荷蘭的英國醫(yī)生科學(xué)家簡·英格豪斯(Jan Ingehousz)發(fā)表了他關(guān)于綠色植物在陽光下可以吸收二氧化碳并釋放氧氣的發(fā)現(xiàn),并指出綠色植物有在光照下凈化普通空氣的能力,這也是光合作用的雛形。 在實(shí)驗(yàn)中,他將薄荷放入不含氧氣的容器中,觀察到幾天后薄荷產(chǎn)生的物質(zhì)使封閉的空氣再次支持燃燒,這就是后來認(rèn)為的氧氣。并且陽光下,植物葉子浸泡在水中時(shí),其綠色部分下面會出現(xiàn)小氣泡,而在黑暗中不會,在非綠色部分也不會。同時(shí),他還觀察到在黑暗中植物釋放二氧化碳?xì)怏w“破壞空氣”(后被認(rèn)為是呼吸作用),但在光照下光合作用的速率遠(yuǎn)高于這種破壞作用的速率。
其他科學(xué)家通過前人的啟發(fā),研究二氧化碳、氧氣、 有機(jī)物 (尤其是糖類)之間的關(guān)系,終于在19世紀(jì)末建立了最初的光合作用的化學(xué)反應(yīng)方程(并不準(zhǔn)確): 6 CO 2 + 6 H 2 O C 6 H 12 O 6 + 6 O 2 (反應(yīng)條件為:光照,場所:植物) 20世紀(jì)中期,美國科學(xué)家卡爾文(Melvin Calvin)及其同事采用放射性同位素和色譜法等方式,通過追蹤碳元素同位素,深入了解了光合作用中二氧化碳的應(yīng)用與路徑,并于1961年獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。 這個(gè)過程現(xiàn)在被命名為“卡爾文循環(huán)”。
1954年,美國科學(xué)家Daniel Israel Arnon等人提出“同化力”,同時(shí),發(fā)現(xiàn)葉綠體在光照下可以合成ATP,即發(fā)現(xiàn)了光合磷酸化的過程。
1957年,希爾(R. Hill)等人在愛默生(Emerson)關(guān)于 光合效率 的研究基礎(chǔ)上提出了 雙光系統(tǒng) (two photosystem)的概念, 將小于或等于680nm波長的光系統(tǒng)定義為光系統(tǒng)II(PSII),將大于680nm波長的光系統(tǒng)稱為光系統(tǒng)I(PSI)。 同年,美國科學(xué)家D.I. Arnon又發(fā)現(xiàn)了光合磷酸化與Hill反應(yīng)相偶聯(lián),再次論述了同化力的作用。 1965年,美國科學(xué)家伍德沃德(Robert Woodward)憑借有機(jī)合成 葉綠素 獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。 1966年,澳大利亞植物生理學(xué)家、生化學(xué)家Marshall Davidson Hatch和英國植物生物學(xué)家、生化學(xué)家Charles Roger Slack發(fā)現(xiàn)了一些植物葉肉細(xì)胞中產(chǎn)生四碳化合物,運(yùn)送至 維管束 鞘細(xì)胞中以釋放二氧化碳用于卡爾文循環(huán),將這個(gè)途徑命名為“Hatch and Slack pathway”。 1988年,德國科學(xué)家Johann Deisenhofer,德國生化學(xué)家Robert Huber和德國生化學(xué)家Hartmut Michel憑借對于光合反應(yīng)中心的三維 結(jié)構(gòu)的確定獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。 1997年,美國生化學(xué)家Paul Boyer和英國生化學(xué)家John Walker因闡明ATP合成的 酶促機(jī)制 ,共同獲得1997年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。
光子學(xué)說的提出 1905年,愛因斯坦提出了光子學(xué)說,并于1912年闡述了光化學(xué)當(dāng)量定律。德國生理生化學(xué)家瓦博(Warburg)開始進(jìn)行相應(yīng)實(shí)驗(yàn)并得出與理論計(jì)算完全一樣的結(jié)果。同時(shí),瓦博的學(xué)生愛默生(R.Emerson)持反對意見,認(rèn)為光合放氧的最低量子值為8。如今愛默生的觀點(diǎn)獲得廣泛接受。
研究進(jìn)展 發(fā)生于20世紀(jì)的一系列重大突破大大改變了光合作用研究的方向和范本,極大限度地綜合了物理學(xué)、化學(xué)等學(xué)科理論與方法。
各國科學(xué)家對于光合作用相關(guān)主題的研究從未中斷,如發(fā)現(xiàn) 葉綠體蛋白 降解新途徑途徑介導(dǎo)植物器官發(fā)育和抗逆境過程,仿生水裂解催化劑的研發(fā),制作光合作用 生物電池 并應(yīng)用于衰老動物細(xì)胞,與 細(xì)胞色素c 結(jié)合的酸桿菌同型二聚體反應(yīng)中心的結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)等等。
相關(guān)名詞
光合效率 光合效率 (photosynthetic efficiency)指在一定時(shí)間范圍內(nèi)、一定光照強(qiáng)度下,光合作用反應(yīng)的多少。每吸收一摩爾二氧化碳,則約有114千卡自由能儲存在植物中。
光合色素 光合色素 是一類光合有機(jī)體中含有的捕獲光能量的有機(jī)色素,有 葉綠素 (chlorophyll)、 類胡蘿卜素 (carotenoid)和 藻膽素 (phycobilin)三類。
光呼吸 光呼吸 (photorespiration),又稱為乙醇酸氧化途徑(glycollic ac id oxidation pathway)或C 2 循環(huán)(C 2 cycle),是植物的綠色細(xì)胞依賴光照吸收O 2 放出CO 2 的過程。該過程與光合作用密切相關(guān),以C 2 化合物(乙醇酸)為底物,由 葉綠體 、 過氧化物酶體 、 線粒體 協(xié)同完成。一般生活細(xì)胞的呼吸對于光照沒有特殊要求,即有無光照均可,稱為暗呼吸。
意義影響 光合作用對于地球上絕大多數(shù)生命的存在至關(guān)重要。
制造有機(jī)物 如果光合作用停止,地球上很快就會沒有食物或其他 有機(jī)物 。大多數(shù)生物便都會消失,地球的大氣層很快就會變得幾乎沒有氣態(tài)氧。 因此,人們把地球上的綠色植物比作“綠色工廠”,綠色植物的生存離不開自身進(jìn)行光合作用產(chǎn)生的有機(jī)物,而人類和動物的食物也直接或間接地來自光合作用產(chǎn)生的有機(jī)物。
轉(zhuǎn)化并儲存太陽能 數(shù)百萬年前,植物進(jìn)行光合作用產(chǎn)生的能量還負(fù)責(zé)為工業(yè)社會提供化學(xué)燃料,即煤、石油、天然氣,地球上幾乎所有生物都直接或間接地利用著這些能量。這些燃料中含有的能量都是被古代植物通過光合作用儲存起來的,只是現(xiàn)代文明將這些曾經(jīng)從空氣中去除的CO 2 又返還回去,預(yù)計(jì)這一現(xiàn)象將對地球氣候產(chǎn)生重大影響。
使大氣中碳氧平衡 在人口快速增長的現(xiàn)代,對食物、材料、能源需求的增長,導(dǎo)致了對光合作用產(chǎn)物轉(zhuǎn)化為對人類有用的產(chǎn)品的效率需求增長。 而如今園林、城規(guī)建設(shè)中的 碳氧平衡 法也旨在解決當(dāng)前問題,以平衡城市中居民呼出及其他燃質(zhì)產(chǎn)生的CO 2 ,以達(dá)到大氣中 碳氧平衡 。
對生物進(jìn)化有重要作用 光合作用產(chǎn)生氧氣和糖類,為有氧呼吸作用的生物創(chuàng)造了便利條件,提供能量供生物使用。 并且氧氣在太陽光紫外線的照射下會形成高空臭氧層(O 3 ),有效防止紫外線直接照射地球表面的生物造成傷害,保證 生物圈 的正常形成與運(yùn)作。